CRISPR-Cas13体系能够靶向修改RNA,被称为“RNA魔剪”。跟着科学家们研讨的深化,其宗族成员不断强壮。近来,宣布在《天然·通讯》的一项效果,揭开了“RNA魔剪”宗族最年青成员“CRISPR-Cas13d”的奥秘面纱。
这项效果来自福建师范大学欧阳松应教授团队。该团队解析了瘤胃球菌的Cas13d蛋白(简称UrCas13d)与crRNA二元复合物高分辨率晶体结构,提醒了UrCas13d加工前体crRNA的酶活性关键位点,判定了crRNA的距离序列和靶向RNA之间的错配耐受性等之前没有研讨清楚的问题。
“这就像飞机规划工程师取得了规划并制作一架飞机的图纸与工序,为修补或规划出更超卓的飞机供给了蓝图。”欧阳松应标明,这为进一步改造Cas13d作为核酸修改及检测东西,并发挥其在处理人类疾病与健康等问题上的使用潜力,供给了厚实的结构根底和理论依据。
CRISPR-Cas体系是一种原核生物(细菌和古细菌)的免疫防护体系,该体系表达的非编码RNA(crRNA)及其相关Cas蛋白组成的复合物,使得原核生物能够辨认而且“撕碎”侵略噬菌体的核酸物质(DNA或许RNA),用以坚持自身遗传物质的“纯真”,在原核生物的进化中起到重要作用。
“正是因为这种准确地靶向切开特定核酸序列的功用,CRISPR-Cas体系被开发成高效的基因修改东西,能够对遗传物质DNA或RNA,进行依靠核酸序列信息的准确辨认和切开。”欧阳松应说,其间名声在外的CRISPR-Cas9体系能高效地修改DNA序列,用于纠正个别细胞内的基因缺点,给很多遗传疾病和稀有病医治带来了期望,该体系现已从试验室研讨阶段进入到临床研讨阶段,具有治好或防备多种人类疾病的潜力。
近年来,源于生物学研讨及医学范畴的巨大使用潜力,一类能够特异地靶向检测与修改RNA的CRISPR-Cas体系被发现并报导出来,命名为Cas13(包含了a、b、c、d四个宗族成员)体系。这一针对RNA的修改东西能够在RNA水平调理基因的功用,而不会对基因自身构成永久性改动。
2018年4月,美国索尔克研讨所一个课题组和美国Arbor生物技能公司的课题组别离报导了经过生物信息学办法挑选,并经过功用试验验证的新式Cas蛋白,命名为Cas13d。作为最年青的成员,Cas13d与其他“兄弟姐妹”在功用上有着相似之处,但更有其共同之处。
“关键在于巨细。”欧阳松应介绍,Cas13d的蛋白序列长度约为930个氨基酸,比其他Cas13宗族成员显着偏小,比Cas9更是小33%,这种尺度使其更简单包装到容量较小的载体中,如腺相关病毒(AAV)载体,因此在开发新药、新资料和新的确诊办法上具有广泛使用潜力。
结构生物学是分子生物学、生物化学及生物物理学的分支学科,关怀的是生物大分子(例如蛋白质分子和核酸分子)的分子三维结构(包含构架和形状),取得它们的结构信息,并研讨生物大分子的结构与功用之间的联络。
“一切的生命活动都是经过种种生物大分子的相互作用来完成,而结构生物学能够解说生物大分子的构象和相互作用的方法,从原子水平提醒生命进程的具体机制,使人们‘知其然而知其所以然’。”欧阳松应和记者说,现在结构生物学的研讨规模现已涉及到大多数重要的生命活动,分子生物学的每一个前沿打破都与结构生物学密切相关。
在本研讨中,欧阳松应课题组将结构生物学与生命科学前沿研讨课题结合,解析了UrCas13d蛋白和crRNA二元复合物的高分辨率晶体结构,能够直观看到每一个原子的方位及它们之间的相互作用细节信息。
“当侵略者到来,CRISPR-Cas体系会在‘指挥官’(前导序列)的调控下转录出两种‘防护资料’,其间一种便是前体crRNA,另一种是咱们研讨的Cas蛋白。”欧阳松应比方说。这一研讨清楚地解说了Cas13d这把“新式魔剪”,终究采用了什么样的空间结构布局来加工前体crRNA,并怎么结合老练的crRNA,构成具有辨认靶向RNA才能的功用复合物,然后进一步研讨清楚该蛋白具有的crRNA依靠的RNase活性的分子机理。
相关研讨标明,Cas13d可做为一种强壮RNA修改东西,用于纠正老年痴呆症患者细胞中引起疾病的蛋白质失衡。一起,Cas13d可当作一种可控制的RNA结合模块,有用靶向细胞内的RNA转录物,为转录组工程和疾病医治供给了一个通用渠道。
“该研讨揭开了CRISPR-Cas13d体系的奥秘面纱,对其技能机制特色有了更深刻理解,有助于这项技能更广泛地使用,然后造福人类。”欧阳松应说。
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